基隆氣象站設立於民國35年10月1日,站區位於基隆港港區以配合基隆港建設與航運安全,設立之初借用基隆港務局二沙灣驗潮站舊址為氣象站觀測場所,並於基隆海港大樓7樓辦公室做為對外報導及資料供應,後來配合基隆港務局擴建,觀測坪於民國59年遷移至海港大樓7樓。但因使用面積過小,氣象站於民國60年遷移至外木山地區,但無線電發報電碼作業仍維持於海港大樓內,後來由於台電高壓纜線通過外木山觀測坪上空影響觀測,故於半年後氣象站又遷回至海港大樓,同時商借6樓用地,並將觀測坪建於6樓屋頂,成為現今基隆氣象站的作業規模。 現今基隆氣象站緊鄰基隆港,位於基隆海港大樓6、7樓,是台灣陸地最北邊之地面綜觀氣象站。